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科技服務

SCIENCE AND TECHNOLOGY SERVICE

真菌基因組組裝

產品簡介

 基因組從頭組裝(denovo)是指在不依賴參考基因組的情況下對真/細菌進行基因組測序及拼接組裝,從而繪制該物種的全基因組序列圖譜。真菌及細菌基因組一般較小,真菌在100M內,采用三代測序技術可組裝出較高質量基因組。

研究內容

1) 數據質控
2) 基因組組裝;
3) 基因組情況評估
4) 基因組組分分析:
    編碼基因預測;重復序列注釋;非編碼RNA預測;假基因分析
6) 基因功能注釋:
    通用數據庫注釋:GO, KEGG, COG, Swiss-prot, Nr, KOG, pfam;
7) 分泌蛋白分析;各專用數據庫注釋

8) 比較基因組學分析

結果展示

送樣建議

1、真菌需純培養以避免雜菌污染,菌絲量200mg以上;
 2、DNA要求:總量≥10ug,濃度≥50ng/μl,OD260/280:1.8-2.0,電泳要求:主帶清晰,無降解或輕度降解;

010-80543251

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