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科技服務

SCIENCE AND TECHNOLOGY SERVICE

真核轉錄組測序

產品簡介

 轉錄組測序(Transcriptome Sequencing)是對某一物種特定時間點或特定條件下的mRNA進行高通量測序。轉錄組測序能夠動態反映基因的轉錄水平,同時可鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本,并且提供樣品特異的轉錄本序列結構信息。

研究內容

   

有參考基因組 

   

無參考基因組

1) 與參考基因組比對;

2) 基因結構優化;

3) 新轉錄本預測;

4) 可變剪接分析;

5) SNP、Indel分析;

6) 轉錄組因子分析;

1) 轉錄組本拼接;

2) Unigene功能注釋;

3) CDS預測;

4) SNP分析;

5) SSR分析;

6) 轉錄組因子分析;

7) 樣品相關性分析;

8) 基因表達水平分析;

9) 基因表達差異分析;

10) 差異基因功能富集分析;

11) 蛋白互作網絡分析;

12) 分析結果可視化。

7) 樣品間相關性分析;

8) 基因表達水平分析;

9) 基因表達差異分析;

10) 差異基因功能富集分析;

11) 蛋白互作網絡分析;

12) 分析結果可視化。

結果展示

送樣建議

1) 樣品類型:總RNA;

2) 樣品濃度:≥50ng/μg;

3) RNA總量:≥1μg;

 4) RNA純度:OD260/280:1.8-2.0;OD260/230≥1.8,260處有正常峰值;

 5) RNA完整度:電泳檢測28s/18s≥1.5或RIN≥6.8(動物)、6.3(植物、真菌),基線平整(軟體等無28S物種)。

010-80543251

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