產品簡介

 長鏈非編碼RNA測序（lncRNA Sequencing）是一種使用特定方法降低樣本中rRNA豐度，對富集到的RNA進行文庫構建，再對測序數據進行信息分析的研究方法。可一次獲得樣本中幾乎全部的lncRNA信息，對lncRNA的類別、功能進行全方位深入分析，從而快速全面準確地獲得與特定生物學過程相關的lncRNA的信息。

研究內容

1) 測序質量值分布統計；

2) 測序數據產出統計；

3) 與參考基因組比對分析；

 4) RNA-Seq整體質量評估：Insert長度檢驗；測序隨機性分析；測序飽和度分析；

5) 轉錄本拼接；

6) 已知lncRNA比對分析與統計；

7) 候選lncRNA基本篩選；

8) class_code的分布；

 9) 候選lncRNA編碼潛能篩選（CPC、CNCI分析，pfam蛋白結構域分析，編碼潛能預測維恩圖）；

10) 最終過濾結果管道圖；

11) lncRNA靶基因預測（trans和cis作用）；

12)  lncRNA表達定量分析；

13) lncRNA差異表達分析；

14) 樣品間lncRNA相關性分析（含生物學重復樣品）；

15)Cis作用差異lncRNA靶基因注釋富集分析；

16)Cis作用差異lncRNA靶基因PPI分析；

17)Trans作用差異lncRNA靶基因注釋富集分析；

18) Trans作用差異lncRNA靶基因PPI分析；

19)mRNA基因表達定量；

20)重復相關性檢測（有生物學重復）；

21) 差異表達基因篩選（兩個或以上樣品）；

22) 差異表達基因聚類分析（兩個或以上樣品）；

23)差異表達基因的功能注釋（兩個或以上樣品）；

24)差異表達基因的GO和KEGG富集分析（兩個或以上樣品）；

25)差異表達基因蛋白互作網絡；

26)lncRNA與mRNA表達水平比較；

結果展示

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