產品簡介

 環狀RNA（circular RNA）是5’端和3’端共價結構閉合環狀的非編碼RNA，是廣泛存在于動植物中的一種特殊的lncRNA，具有很高的保守性和組織特異性，獨特的環狀結構使其不易被RNase降解，在胞內具有較強的穩定性。按其來源可分為內含子CircRNA和外顯子CircRNA兩類，主要通過（1）作用于轉錄組因子，（2）競爭性結合miRNA，（3）結合核糖體誘導開環再重新表達等三種方式實現其調控基因表達的功能。CircRNA一經發現就因其獨特的存在形式引起科學家的廣泛興趣，隨著近幾年測序技術的發展，CircRNA檢測技術亦日漸成熟。

研究內容

1) 測序質量值分布統計；

2) 測序堿基質量控制；

3) 測序數據產出統計；

4) 測序文庫質量評估；

5) 與參考序列進行比對（比對效率統計；比對結果作圖）；

6) CIRI識別環狀RNA；

7) circRNA的鑒定；

8) circRNA的統計；

9) circRNA來源基因功能注釋;

10) circRNA表達定量分析（定量及統計）；

11) 聚類分析；

12) 樣品間circRNA相關性分析（含生物學重復樣品）；

13) circRNA差異表達分析；

14) 差異表達circRNA數目統計及聚類分析；

15) 差異表達circRNA來源基因的功能注釋（NR，GO，KEGG等）及富集分析；

16) 差異表達circRNA來源基因蛋白互作網絡分析。

結果展示

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