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科技服務

SCIENCE AND TECHNOLOGY SERVICE

BSA性狀定位

產品簡介

BSA(Bulked segregant analysis,BSA),也稱混合分組分析法或集群分離法,是一種簡單快速定位基因的方法。它是將目標性狀表型極端的高、低兩組個體的DNA分別混成DNA池,然后利用分子標記在兩池中進行標記和性狀間的關聯分析。該方法適用于由單基因控制的質量性狀或數量性狀的主效基因定位。
隨著高通量測序技術的興起,基于全基因組重測序的BSA方法廣泛地應用在糧食作物、經濟作物、蔬菜花卉等物種中,并且成功定位出了許多農藝性狀相關的基因。BSA作為當下最流行的基因定位方法,因其具有“快速、準確、經濟、實用”的特點,正受到廣大育種家的熱烈追捧。

研究內容

 基于比對分析發現的SNP、InDel標記,進行子代SNP、InDel頻率差異分析,然后進行目標性狀區域定位,最后進行候選基因提取和功能注釋。

結果展示

送樣建議

1) 親本:目標性狀在親本間具有顯著差異;

 2) 子代混池:a、質量性狀中混池規模以隱性個體數目為準,按照1:1混池;b、數量性狀的表型值一般會符合正態分布,為保正基因定位結果精確性一般選擇表型值為10%~20%的個體進行混池為宜。無論質量性狀或者數量性狀,混池規模建議在30+30以上;

 3) 適用群體:a、純合物種,F2、RILs、BC、DH等分離群體均可;b、雜合物種,一般使用F1群體;

4) 組織樣和DNA質量要求與全基因組重測序相同。

010-80543251

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