產品簡介
完整的轉錄本包括了從5’端到3’端polyA尾的序列，長度集中分布在1-6kb。二代測序技術由于讀長較短，得到的測序片段需要拼接，得到的轉錄本可能會產生拼接錯誤和較多的嵌合體，從而不能得到完整的轉錄本。第三代測序技術Pacbio利用單分子實時測序技術（SMRT），由于其超長的讀長（平均15kb），無需拼接即可直接獲取完整的全長轉錄本，因此可得到更高質量的轉錄本，有利于mRNA結構的研究，如可變剪切、融合基因、等位基因表達等。
研究內容
|
有參全長轉錄組分析內容
|
|
無參全長轉錄組分析內容
|
|
1) 數據質控、轉錄本分類；
2) 轉錄本聚類與校正；
3) 與參考基因組比對；
4) 進行可變剪切分析；
5) 新基因預測；
6) 融合基因分析；
7) 作為參考序列，定量分析；
8) 編碼蛋白框預測；
9) lncRNA預測。
|
|
1) 數據質控、轉錄本分類；
2) 轉錄本聚類與校正；
3) 七大轉錄本數據庫注釋；
4) 作為參考序列、定量分析；
5) lncRNA預測；
6) 編碼蛋白框預測。
|
結果展示
送樣建議
1) 樣品類型：組織樣或總RNA；
2) 樣品濃度：≥300ng/μg；
3) RNA總量：≥10μg；
4) RNA純度：OD260/280：1.8-2.0；OD260/230≥1.8，260處有正常峰值；
5) RNA完整度：電泳檢測28s/18s≥1.5或RIN≥8，基線平整（軟體等無28S物種）。
