產品簡介
近年來，高通量測序技術的迅猛發展，極大地推動了全基因組測序工作的展開，全球已有幾百種的植物和動物完成了全基因組測序工作。通過全基因組測序，人們可以獲得物種的全基因組序列圖譜，從而為該物種后續的研究和產業化應用奠定基礎。隨著高通量測序技術的發展，成本的降低，動植物基因組組裝不再 是大牛的專利，假如您致力于該物種的深入研究，denovo測序組裝它的基因組必然會推動您的研究進程。
基因組從頭測序（De novo sequencing）是在不依賴參考基因組的情況下對某物種進行基因組測序及拼接組裝，從而繪制該物種的全基因組序列圖譜。基因組測序不僅可以獲得該物種的全基因組序列圖譜，同時也為后續物種起源進化及特定環境適應性的研究奠定了基礎。
研究內容
基因組Survey：
1) K-mer分析以及基因組大小估算；2) 雜合率估算；3) 初步組裝；4) GC含量評估。
基因組組裝：
1) 組裝結果評估；2) GC-Depth分布分析；3) GC含量分布分析；4) 測序深度分析；5) 常染色體區域覆蓋度評估（需要客戶提供BAC或者Fosmid序列）；6) 基因區覆蓋度評估（需要客戶提供EST或者轉錄組序列）。
基因組注釋：
1) repeat注釋；2) 基因預測；3) 基因功能注釋；4) ncRNA注釋。
比較基因組學分析：
1) 基因聚類分析（也叫基因家族鑒定，動物TreeFam；植物OrthoMCL）；2) 物種系統進化分析；3) 物種分歧時間估算（需要標定時間信息）；4) 基因組共線性分析；5) 全基因組復制分析（動物WGAC；植物WGD）。
定制化個性化分析：
結合客戶需求，協商確定個性化分析內容。
結果展示
送樣建議
1) 樣品類型：DNA；
2) 樣品濃度：≥50 ng/ul（Qubit定量）；
3) 樣品總量：>60ug（Qubit定量）；
4) 樣品純度：OD260/280：1.7 ~ 2.2；OD260/230≥0.5；260吸收峰正常不偏移；無蛋白質、RNA或肉眼可見雜質污染；
5) 若提供組織樣品，則植物樣本需為無菌黃化苗、組培樣品或嫩葉；
6）若需要做Hi-C測序，則需要提供新鮮的活體。
注：需從同一個體取樣，預防由于個體差異對后續拼接造成的影響，調研圖和精細圖也需要從同一個體取樣；如無選取同一個體的條件，須再溝通決定取樣方式。
